Pendidikan berbasis Islam memainkan peran penting di Desa Trombol, terbukti dengan besarnya jumlah madrasah-sekolah Islam yang menyediakan pendidikan agama di samping kurikulum akademik yang komprehensif-yang ada di desa ini. Sebut saja MIM Trombol dan MTs Trombol, juga Madin Nurul Mubtadi (Trombol RT 25), Madin Raudhatul Mujawwidin (Kadisono RT 12), TPA Al-Kahfi (Ngunut RT 01), TPA Darussalam (Trombol RT 19), TPQ Baitul Qur’an (Pondok RT 20), TPQ MTA (Trombol RT 26), dan Madin Bendorejo (Bendorejo RT 17). Madrasah-madrasah ini menawarkan lingkungan pengasuhan bagi siswa untuk mengembangkan landasan yang kuat baik dalam ajaran Islam maupun pendidikan umum. Kehadiran madrasah juga mencerminkan komitmen desa untuk melestarikan dan mempromosikan nilai-nilai Islam tanpa mengabaikan kualitas pendidikan generasi muda.

Selain madrasah, Desa Trombol dilengkapi dengan dua TK Pertiwi, taman kanak-kanak negeri yang menjadi pijakan awal bagi para pelajar muda. Kedua TK Pertiwi berfokus pada penyediaan pendidikan anak usia dini yang menyeluruh, menekankan perkembangan kognitif dan sosial. Untuk memenuhi kebutuhan pendidikan dasar desa, saat ini Desa Trombol juga memiliki dua sekolah dasar negeri. Baik SDN 1 dan SDN 2 Trombol mengikuti kurikulum nasional dan memberikan pendidikan yang komprehensif kepada siswa. Tak hanya dari Trombol, beberapa siswa yang mengenyam pendidikan di kedua sekolah dasar ini juga berasal dari desa atau kecamatan lain. Para siswa ini dibimbing oleh tim guru berdedikasi yang menumbuhkan lingkungan belajar yang mendukung dan inklusif. Selain mata pelajaran akademik, mereka juga belajar seni, kerajinan, olahraga, dan kebiasaan bermanfaat lainnya seperti piket bersih-bersih, kerja sama kelompok, serta sopan santun terhadap guru dan teman-teman.